Files
Pikaliov 2c6a00a4ca fuse_proj: Initial operational package for 3 researchers (Pavlenko/Blizno/Moroz)
Multimodal fusion research on StripNet+GTA-UAV proxy:
- 3 independent fusion tracks: condition-aware (A), token/bottleneck (B), role-aware (C)
- Shared interfaces, protocol, dataset audit, baseline benchmarks
- Canonical version-chain references to vault (SPEC, ANALYSIS, TRIAGE)
- Personalized task plans and decision tables for each researcher
- 3 generated DOCX task assignment files with milestones and DoD checklist
- Full modality dropout diagnostics and missing-modality robustness requirements
- Data contract, benchmark registry, experiment tracking infrastructure

Operational documents:
- docs/00_project/: MERIDIAN context, protocol, repository reuse guide, experiment specification
- docs/01_tasks/: Master assignment + 3 individual researcher tracks + joint integration
- docs/02_references/: Core literature, version-chain bases, code maps
- docs/03_codebase_guides/: Existing code snapshots from vault
- scripts/: gen_task_plans.js (DOCX generation), placeholder infrastructure
- vendor_reference/: Snapshots of caption_test, depth_edges_annotate, existing SOFIA/SegModel code
- reports/, results/, experiments/: Shared output structure for all 3 researchers

3 DOCX files generated from gen_task_plans.js (Times New Roman 14pt, GOST format):
- План_заданий_Павленко_БВ.docx (Condition-Aware track, fusion API owner)
- План_заданий_Близно_МВ.docx (Token/Bottleneck track, benchmark owner)
- План_заданий_Мороз_ЕС.docx (Role-Aware track, data contract owner)

Co-Authored-By: Claude Haiku 4.5 <noreply@anthropic.com>
2026-06-11 17:16:57 +03:00
..

Multi-Modal Annotation Pipeline

Автоматическая генерация 4 модальностей (depth, edges, segmentation, canopy height) из RGB-изображений аэрофотосъёмки. Поддерживает три датасета:

Модальность Модель Выход Скорость
Depth DA3-LARGE-1.1 (411M) grayscale [256x256] 18.4 img/s
Edges Sobel из depth (CPU) grayscale [256x256] 419.6 img/s
Segmentation SegEarth-OV3 (SAM 3.1) class IDs [256x256] ~3.5 img/s
CHMv2 DINOv3-ViTL16 (337M, FP32) grayscale [256x256] 31.7 img/s
Consolidate SafeTensors (CPU) .safetensors per image ~5000 img/s
Датасет Изображения Сегм. классы Скрипт
World-UAV 973K (486K DB + 486K query) 17 (unified) python -m src.main
UAV_VisLoc 81K (75K DB + 6.7K drone) 17 (unified) python scripts/run_uav_visloc.py
GTA-UAV-LR 48K (15K sat + 34K drone) 17 (unified) python scripts/run_gta_uav.py

Все датасеты используют единый набор 17 классов (scripts/seg_classes.py) для совместимости при transfer learning.

Quick Start

# World-UAV (основной датасет)
python -m src.main

# UAV_VisLoc
python scripts/run_uav_visloc.py

# GTA-UAV-LR
python scripts/run_gta_uav.py

# Тесты (149 шт, без GPU)
python -m pytest src/tests/ -v

Структура проекта

.
├── in/
│   ├── config_files/              # Gin-конфигурация
│   │   ├── pipeline.gin           # Пути, стадии, save_npy/save_vis, resume, source
│   │   ├── models.gin             # Model IDs, weights_dir
│   │   ├── hardware.gin           # GPU profile, batch_size (None=auto), FP16
│   │   ├── segmentation.gin       # 11 промптов, threshold=0.15
│   │   └── input.gin              # image_size (256)
│   └── weights/                   # Веса моделей (не в git, >50MB)
│       ├── models--depth-anything--DA3-LARGE-1.1/
│       ├── sam3.1/sam3.1_multiplex.pt
│       └── dinov3-chmv2/
├── src/
│   ├── main.py                    # Entry point + pipeline orchestration
│   ├── nn/                        # Вендорированные нейросетевые пакеты
│   │   ├── __init__.py            # Регистрация sys.path при импорте
│   │   ├── segearth_ov3/          # SegEarth-OV-3 + SAM3 (копия репозитория)
│   │   │   ├── segearthov3_segmentor.py
│   │   │   ├── sam3/              # SAM 3.1 backbone (134 .py файла)
│   │   │   │   └── assets/bpe_simple_vocab_16e6.txt.gz
│   │   │   └── pamr.py
│   │   └── depth_anything_3/      # Depth-Anything-3 (копия пакета)
│   │       ├── api.py             # DepthAnything3 class
│   │       ├── model/             # DA3 архитектура (DinoV2 + DPT)
│   │       ├── configs/           # YAML-конфиги моделей
│   │       └── utils/             # I/O, export, geometry
│   ├── augmentor/
│   │   ├── models.py              # Загрузка/выгрузка моделей
│   │   ├── inference.py           # Inference + post-processing (depth, chmv2, edges, segm)
│   │   ├── io_utils.py            # Сохранение файлов (sync + async) + палитра
│   │   └── dataset.py             # Discovery, filtering, PyTorch Dataset
│   ├── conf/                      # Gin-configurable dataclasses
│   ├── utils/                     # Profiler, benchmark, GPU utils
│   └── tests/                     # 149 тестов (pytest)
├── scripts/
│   ├── seg_classes.py             # UNIFIED_PROMPTS — 17 классов (единый источник)
│   ├── run_uav_visloc.py         # Запуск для UAV_VisLoc
│   ├── run_gta_uav.py            # Запуск для GTA-UAV-LR
│   └── migrate_layout.py         # Миграция со старого prefix-формата
└── docs/
    ├── segmentation_class_analysis.md   # Анализ классов сегментации (11 классов)
    ├── segearth_ov3_architecture.md     # Архитектура SegEarth-OV3 + SAM 3.1
    ├── analysis_optimization.md         # Анализ производительности и оптимизации
    └── skills_optimization_io_dl_ml.md  # Справочник приемов оптимизации

src/nn/ -- вендорированные пакеты

Нейросетевые модели встроены внутрь проекта в директории src/nn/. Не нужно клонировать внешние репозитории или устанавливать пакеты через pip:

  • src/nn/segearth_ov3/ -- полная копия SegEarth-OV-3: сегментатор + SAM3 backbone + BPE vocab
  • src/nn/depth_anything_3/ -- полная копия пакета из Depth-Anything-3

При import src.nn автоматически регистрируются пути в sys.path, и все внутренние импорты обоих пакетов работают без изменений.

Конфигурация

pipeline.gin

PipelineConfig.input_root = '/path/to/UAV-GeoLoc'     # Исходный датасет
PipelineConfig.output_root = '/path/to/World-UAV-aug'  # Куда сохранять
PipelineConfig.stages = ['depth', 'edges', 'segmentation', 'chmv2']
PipelineConfig.save_npy = False            # True = float16/uint8 .npy (промежуточные)
PipelineConfig.save_vis = True             # True = .png визуализации
PipelineConfig.save_safetensors = True     # True = .safetensors (для обучения, zero-copy mmap)
PipelineConfig.cleanup_npy = False         # True = удалить .npy после консолидации
PipelineConfig.resume = True               # Пропускать уже обработанные
PipelineConfig.subset = None               # None=все, 'Rot', 'Country', 'Terrain'
PipelineConfig.source = 'db'               # 'db' = спутник, 'query' = БПЛА, None = оба

segmentation.gin (unified 17 классов)

Все датасеты используют единый набор 17 классов из scripts/seg_classes.py для совместимости при transfer learning (pretrain GTA-UAV → fine-tune UAV_VisLoc/World-UAV). Не каждый датасет содержит пиксели каждого класса — это нормально (0 пикселей = 0 loss).

ID Промпт World-UAV UAV_VisLoc GTA-UAV
0 background + + +
1 building + + +
2 road + + +
3 vegetation + + +
4 water + + +
5 sand and gravel ground + + +
6 rocky terrain + + +
7 farmland + + +
8 railway + + +
9 parking lot + + +
10 sidewalk + + +
11 bare soil and plowed field + + +
12 roof and rooftop + + +
13 sports field and playground + + редко
14 muddy ground and wetland + + reclassify*
15 embankment and levee + + редко
16 swimming pool + редко +

* GTA-UAV: seg_reclassify_wetland=True — wetland переклассифицируется в vegetation/bare soil (ложные срабатывания на холмах GTA V).

Post-processing (после SegEarth-OV3):

  • seg_fix_dark_water=True (все датасеты) — background на тёмных изображениях (mean < 0.24, std < 0.18) → water. Satellite GTA-UAV: bg 57% → 5%.
  • seg_reclassify_wetland=True (только GTA-UAV) — wetland → vegetation (зелёный) / bare soil (коричневый). Drone: ложный wetland 14% → 0%.

Подробный анализ: docs/segmentation_class_analysis.md

hardware.gin

HardwareConfig.profile_name = 'rtx4090'
HardwareConfig.total_ram_gb = 24.0
HardwareConfig.use_fp16 = True
HardwareConfig.batch_size = None   # None = auto (из свободного VRAM)
HardwareConfig.num_workers = 4

Как работает пайплайн

Стадии выполняются последовательно -- одна модель за раз:

DEPTH:        загрузка DA3 -> auto_batch_size из VRAM -> все изображения -> выгрузка
EDGES:        загрузка depth PNG/NPY -> Sobel (CPU, batch=32) -> выгрузка
SEGM:         загрузка SegEarth-OV3 -> batched backbone (<=16 img) + per-image grounding -> выгрузка
CHMv2:        загрузка DINOv3 (FP32) -> auto_batch_size из VRAM -> все изображения -> выгрузка
CONSOLIDATE:  сборка depth+edge+segm+chm -> один .safetensors на изображение (CPU)

SegEarth-OV3: backbone SAM 3.1 выполняется одним forward pass на батч до 16 изображений через predict_pil_batch(). Grounding decoder (11 промптов x per-image) -- основной bottleneck (~84% времени). Text embeddings кэшируются при первом вызове. Подробная архитектура: docs/segearth_ov3_architecture.md

auto_batch_size после загрузки модели считывает реальный свободный VRAM:

free_vram = total - reserved
batch = round_down_pow2(free_vram / act_per_sample * 0.7)

Resume проверяет существование файлов в соответствующих директориях модальностей. Пайплайн можно прервать Ctrl+C и перезапустить -- готовые пропускаются.

Формат выхода

Модальность определяется папкой, а не суффиксом файла:

World-UAV-aug/
├── depth/Rot/SouthernSuburbs/DB/img/crop_12_4.png       # vis
├── edge/Rot/SouthernSuburbs/DB/img/crop_12_4.png        # vis
├── segm/Rot/SouthernSuburbs/DB/img/crop_12_4.png        # vis (palette mode P)
├── chm/Rot/SouthernSuburbs/DB/img/crop_12_4.png         # vis
├── npy/depth/Rot/SouthernSuburbs/DB/img/crop_12_4.npy   # float16 intermediate
├── npy/edge/...
├── npy/segm/...
├── npy/chm/...
├── safetensors/Rot/SouthernSuburbs/DB/img/crop_12_4.safetensors  # для обучения
└── manifest.json

SafeTensors (рекомендуемый формат для обучения)

Один .safetensors файл на изображение, содержит все модальности:

Ключ Dtype Shape Описание
depth float16 [1, H, W] Dense depth map, непрерывная [0, 1], per-frame normalized
edge float16 [1, H, W] Dense edge map (Sobel magnitude), [0, 1]
chm float16 [1, H, W] Dense canopy height map, [0, 1], per-frame normalized
segm uint8 [1, H, W] Dense class ID map, значения [0, 16] (17 unified классов)

Преимущества SafeTensors:

  • Zero-copy mmap -- тензор читается прямо с диска без копирования в RAM (~0.1ms)
  • 1 syscall вместо 4 (один файл = все модальности)
  • Безопасность -- нет pickle, нет arbitrary code execution
  • Стандарт HuggingFace -- нативная поддержка в PyTorch

PNG визуализации (только для просмотра)

Стадия Суффикс PNG формат
depth _depth grayscale (L), uint8, value / 255.0 -> [0,1]
edges _edge grayscale (L), uint8
segmentation _segm RGB palette, class ID = argmax по палитре
chmv2 _chm grayscale (L), uint8, value / 255.0 -> [0,1]

Палитра сегментации

ID Класс RGB Датасеты
0 background (0, 0, 0) Black
1 building (220, 40, 40) Red
2 road (160, 160, 160) Gray
3 vegetation (30, 180, 30) Green
4 water (30, 120, 220) Blue
5 sand and gravel ground (180, 140, 80) Tan
6 rocky terrain (120, 100, 80) Brown
7 farmland (200, 200, 50) Yellow
8 railway (100, 60, 120) Purple
9 parking lot (255, 165, 0) Orange
10 sidewalk (200, 200, 200) Light gray
11 bare soil (140, 100, 50) Dark tan
12 rooftop (180, 60, 60) Dark red
13 sports field (50, 200, 150) Teal
14 muddy/wetland (80, 100, 70) Olive
15 embankment (170, 130, 100) Sandy brown
16 swimming pool (0, 200, 255) Cyan

Использование для обучения

Все модальности хранятся как dense tensor maps — прямые тензоры, не RGB-рендеры. Это ключевое решение (см. dialog_fusion_modalities): тензоры сохраняют полную информацию без потерь при квантовании/colormapping и не являются OOD-входом для DINOv3.

SafeTensors (рекомендуемый способ)

from safetensors.torch import load_file
import torch.nn.functional as F

# Zero-copy чтение всех модальностей за ~0.1ms
data = load_file("World-UAV-aug/safetensors/Rot/.../crop_12_4.safetensors")

# Все модальности — dense spatial maps, готовые для injection в backbone
depth = data["depth"]  # [1, H, W] float16, непрерывная глубина [0, 1]
edge  = data["edge"]   # [1, H, W] float16, Sobel magnitude [0, 1]
chm   = data["chm"]    # [1, H, W] float16, canopy height [0, 1]
segm  = data["segm"]   # [1, H, W] uint8, dense class ID map [0, 16]

Подача в Teacher NADEZHDA

Каждая модальность подаётся в свой lightweight aux-encoder, затем через FiLM/Conv1x1 injection в DINOv3 patch tokens:

# Depth / Edge / CHM → [B, 1, H, W] float → Conv aux-encoder → FiLM injection
# Прямые тензоры, НЕ RGB-рендеры (turbo colormap = потеря 70% информации + OOD)
aux_depth = depth_encoder(depth.float())   # [1, H, W] → [C, H, W]
aux_edge  = edge_encoder(edge.float())
aux_chm   = chm_encoder(chm.float())

# Segmentation → dense class ID map → per-class embedding → spatial feature map
# Вариант 1: one-hot → Conv
segm_onehot = F.one_hot(segm.long().squeeze(0), num_classes=17)  # [H, W, 17]
segm_features = seg_conv(segm_onehot.permute(2, 0, 1).float())  # [17, H, W] → [C, H, W]

# Вариант 2: learned per-class embedding (SegAuxEncoder)
# seg_emb = nn.Embedding(17, 32)
# segm_features = seg_emb(segm.long().squeeze(0)).permute(2, 0, 1)  # [H, W] → [32, H, W]

Почему тензоры, а не RGB-рендеры

Формат Пример depth Потеря информации Для DINOv3
float16 тензор (хранится) [0.4231, 0.4235, ...] ~0% Прямой вход в aux-encoder
uint8 grayscale PNG [108, 108, ...] ~0.4% Приемлемо
turbo colormap RGB PNG [R=50, G=180, B=220] ~70% OOD — DINOv3 обучен на натуральных RGB

Для обучения всегда используйте SafeTensors. PNG визуализации — только для просмотра в Obsidian/файловом менеджере.

Миграция со старого формата

Если данные сгенерированы в старом prefix-формате (crop_12_4_depth.png), мигрируйте:

# Сначала проверить (dry-run)
python scripts/migrate_layout.py /mnt/data1tb/cvgl_datasets/World-UAV-aug --dry-run

# Выполнить миграцию
python scripts/migrate_layout.py /mnt/data1tb/cvgl_datasets/World-UAV-aug

Скачивание весов

Веса скачиваются один раз в in/weights/ (~10 GB суммарно):

# DA3-LARGE-1.1 (HuggingFace, открытый доступ)
python -c "
from huggingface_hub import snapshot_download
snapshot_download('depth-anything/DA3-LARGE-1.1', cache_dir='in/weights')
"

# SAM 3.1 (для SegEarth-OV3)
mkdir -p in/weights/sam3.1
cp /path/to/sam3.1_multiplex.pt in/weights/sam3.1/

# CHMv2 DINOv3 (gated, нужен доступ к facebook/dinov3-vitl16-chmv2-dpt-head)
python -c "
from transformers import CHMv2ForDepthEstimation, CHMv2ImageProcessor
model = CHMv2ForDepthEstimation.from_pretrained('facebook/dinov3-vitl16-chmv2-dpt-head')
proc = CHMv2ImageProcessor.from_pretrained('facebook/dinov3-vitl16-chmv2-dpt-head')
model.save_pretrained('in/weights/dinov3-chmv2')
proc.save_pretrained('in/weights/dinov3-chmv2')
"

BPE vocab (bpe_simple_vocab_16e6.txt.gz) уже встроен в проект: src/nn/segearth_ov3/sam3/assets/. Отдельно скачивать не нужно.

Известные особенности

  • CHMv2 работает только в FP32 -- в FP16 выдает NaN. Модель автоматически загружается в FP32 независимо от use_fp16
  • SegEarth-OV3 bottleneck -- grounding decoder (17 промптов x per-image) = ~84% времени инференса. Text embeddings кэшируются. Batch size backbone = 16
  • Post-processing сегментации -- dark water fix (background → water для тёмных изображений) + wetland reclassify (GTA-UAV: wetland → vegetation/bare soil)
  • 16 сцен Country исключены -- неполные (нет DB-кропов). Фильтруются автоматически через INCOMPLETE_SCENES
  • Ледники/снег -- SegEarth-OV3 классифицирует как water (ограничение модели). Класс snow and ice убран как неэффективный
  • Verbose логи подавлены -- DA3, transformers, SAM 3.1, HF Hub. Управляется через _silence_model_loggers()

Оценка времени (RTX 4090, 24 GB, 973K images)

Стадия Время %
Depth ~14.7 ч 16%
Edges ~0.6 ч <1%
Segmentation (bs=16, 17 prompts) ~120 ч ~76%
CHMv2 ~8.5 ч ~8%
Consolidate (.safetensors) ~0.1 ч <1%
Итого ~144 ч (~6 дней)

При обработке только DB (спутник, source='db'): ~486K изображений, ~50 ч. При обработке только query (БПЛА, source='query'): ~486K изображений, ~50 ч.

Тесты

# Все тесты (149 штук, ~2.5 сек, без GPU)
python -m pytest src/tests/ -v

# Только pipeline integration
python -m pytest src/tests/test_pipeline_integration.py -v

# Только inference
python -m pytest src/tests/test_inference.py -v

Все тесты используют mock-модели -- GPU не требуется.

Документация

Документ Описание
docs/segmentation_class_analysis.md Unified 17 классов: анализ World-UAV (392 локации), UAV_VisLoc, GTA-UAV
docs/segearth_ov3_architecture.md Архитектура SegEarth-OV3 + SAM 3.1, pipeline инференса, профиль производительности
docs/analysis_optimization.md Общий анализ и оптимизация пайплайна
docs/skills_optimization_io_dl_ml.md Справочник приемов оптимизации I/O, DataLoader, ML

Зависимости

  • Python 3.10+
  • PyTorch 2.x + CUDA
  • transformers >= 5.5
  • huggingface_hub
  • safetensors >= 0.4
  • gin-config, tqdm, Pillow, coloredlogs, psutil, matplotlib
  • omegaconf, einops (зависимости Depth-Anything-3)
  • iopath (зависимость SAM3)

SegEarth-OV-3 и Depth-Anything-3 вендорированы в src/nn/ -- отдельная установка не требуется.